Références et liens externes
Éric Guichard
Table des matières
1 Quelques pages de graphes, cartes, données
2 Critique des images
3 Quelques analyses
4 Modèles et jeux de données pour épidémiologistes et physiciens
Toutes mes excuses pour la présentation bien trop concise de ces excellents documents.
Merci aux collègues de l'Inria, de l'IXXI, des listes Theuth, Dh et d'autres univers pour certains de ces liens. Ces derniers sont clicables.
1 Quelques pages de graphes, cartes, données
- Quelques productions personnelles (j'assume). Du fait de mon
implication dans le groupe des physiciens de l'équipe SiSyPhe
du laboratoire de physique de l'Ens de Lyon désireux de
comprendre finement l'évolution de la pandémie, fédérés par Patrice Abry, j'ai produit
quelques cartes fixes ou animées du taux de reproduction de la covid-19 en
France: ces cartes et leurs scripts (compressés en .gz) sont dans le dossier IXXI-SiSyPhe.
- Notamment la carte animée de l'évolution de R(t) dans les départements,
- qui fait suite à celle de Patrice Abry
- Une carte mondiale du même type est en cours de production.
N'hésitez pas à produire des variantes avec les scripts à votre disposition. Par exemple en changeant les couleurs limites, la fréquence temporelle, etc. - La page https://app.talkwalker.com/app/project/f0f04705-4e78-4072-9527-376fedaccf62/shared_dashboard/export_DSEU_mH8wt9tV.html montre ce que l'on peut faire en traitant graphes et données, mais n'est pas toujours limpide...
- France (et pays voisin): saluons sur le site web du Monde, le 9 mai 2020, l'apparition de graphes et cartes subtils intégrant la mortalité par tranche d'âge: https://www.lemonde.fr/les-decodeurs/article/2020/05/05/coronavirus-age-mortalite-departements-pays-suivez-l-evolution-de-l-epidemie-en-cartes-et-graphiques_6038751_4355770.html
- Le premier modèle: https://medium.com/@tomaspueyo/coronavirus-act-today-or-people-will-die-f4d3d9cd99ca Il a fait le tour du monde, j'en ai trace avant le 12 mars, je crois l'avoir consulté fin février. Il a énormément de qualités, y compris celle de nous inviter à multiplier par 20 ou 40 le nombre de cas confirmés. seul défaut: nous avoir fait croire qu'un confinement de 15 à 20 jours suffirait. En conclusion, sa lacune essentielle est de ne pas avoir pris en compte les choix politiques des gouvernements. Il faut néanmoins le lire si ce n'est déjà fait.
- Une référence. Apparu très tôt: http://91-divoc.com/pages/covid-visualization. Le premier site à comparer les courbes des pays à partir du 10 mort. Possibilité de choisir des échelles log ou linéaires, de comparer les cas (décès, confirmés, etc.), de mettre en valeur un pays, d'en choisir 10 plutôt que 50, etc. Le graphe a le mérite d'être interactif (pas de log, sauf erreur de ma part).
- Aussi excellent: https://ourworldindata.org. Notamment https://ourworldindata.org/grapher/coronavirus-cfr, qui permet de faire les graphiques ici présentés, de façon interactive (choix des pays, des variables, moyennes mobiles, par millions d'habitants, etc.).
- Dans la même veine: http://boogheta.github.io/coronavirus-countries
- Situation de la France, par département. Excellent (mais désormais daté). https://www.lemonde.fr/les-decodeurs/article/2020/04/01/coronavirus-visualisez-le-nombre-de-personnes-hospitalisees-departement-par-departement_6035199_4355770.html. La source gouvernementale est ici: https://www.data.gouv.fr/fr/datasets/donnees-relatives-a-lepidemie-du-covid-19
- Une carte instructive de la situation européenne (par régions et par centaines de milliers d'habitants): https://legrandcontinent.eu/fr/observatoire-coronavirus. Page encore accessible sur un site qui devient partiellement payant.
- Modéliser mathématiquement une pandémie [vidéo]: https://www.youtube.com/watch?v=fu92X74MS_M. L'auteur (E. Pardoux, 24 mars) évoque explicitement la nécessité de précautions systématiques (masques et tests pour tous); ce qui alimente d'intéressantes questions sur l'articulation entre modèle, réalité sociale et action politique.
2 Critique des images
Quelques types d'images instructives mais plus alarmistes qu'informatives à mon gré et donc partiellement à l'origine de ce journal.D'énormes cercles rouges sur fond noir, la carte est avant tout angoissante. Ceci dit, les sources du site sont fiables, à part des erreurs durant quelques jours pour la France. Site https://systems.jhu.edu, copie d'écran du 23 mars. |
Le site https://coronavirus.politologue.com, copie d'écran du 23 mars. Ce type de graphique donne à penser que la croissance de la pandémie est vertigineuse. |
Figure 1: Exemple de représentations laissant peu de place à l'évolution de la pandémie et à son historique.
3 Quelques analyses
Je prie les lecteurs de m'excuser pour la présentation sans commentaire de ces textes et vidéos, tout en les assurant de l'excellence des idées ou synthèses contenus derrière ces renvois.L'ordre est vaguement temporel: les sources les plus récentes auraient tendance à apparaître en haut de cette liste. Par déontologie, je ne cite pas les articles dans lesquels mon nom apparaît.
- Contre le gouvernement par la peur: https://www.leparisien.fr/societe/covid-19-nous-ne-voulons-plus-etre-gouvernes-par-la-peur-la-tribune-de-chercheurs-et-de-medecins-10-09-2020-8382387.php
- Pourquoi voyons-nous le R(t) croître alors qu'il descend? Le paradoxe de Simpson (aussi appelé «erreur écologique»): https://unherd.com/2020/05/what-the-headline-covid-figures-dont-tell-you/?=frlh.
- Comment penser la crise covid dans la durée avec le pragmatisme sociologique? https://socioargu.hypotheses.org/6191
- Débats sur l'application Stopcovid: ils font l'actualité, en ce
début du mois de mai.
- L'avis de l'Académie des Sciences: https://www.academie-sciences.fr/pdf/rapport/2020_04_10_avis_tracage.pdf.
- Le communiqué de l'Académie de Médecine: http://www.academie-medecine.fr/communique-de-lacademie-nationale-de-medecine-covid-19-tracage-epidemiologique-et-ethique-medicale.
- Celui de la Commission des droits de l'Homme: https://www.cncdh.fr/sites/default/files/avis_2020_-_3_-_200424_avis_suivi_numerique_des_personnes.pdf.
- Solutions techniques pour l'anonymat, la vie privée et outils de type Stopcovid: https://github.com/ROBERT-proximity-tracing/documents/blob/master/Proximity-tracing-analysis-EN-v1_0.pdf
- Bluetooth et ses dangers ou faiblesses: https://risques-tracage.fr/docs/risques-tracage.pdf
- Tribune au sujet de Stopcovid: https://www.lefigaro.fr/vox/politique/stopcovid-il-est-contre-productif-de-proposer-une-solution-techniciste-a-un-probleme-qui-ne-l-est-pas-20200427 (P.-A. Chardel, V. Charolles, M. Delmas-Marty et A. Mhalla).
- Science et politique, par Cédric Villani: https://theconversation.com/de-la-difficile-equation-entre-science-et-politique-138272
- Le casse-tête des tests: https://www.lemonde.fr/les-decodeurs/article/2020/05/15/coronavirus-le-difficile-comptage-des-tests-effectues-en-france_6039795_4355770.html
- Multinationales du numérique et pandémie: projets et bénéfices (Naomi Klein, en anglais): https://www.theguardian.com/news/2020/may/13/naomi-klein-how-big-tech-plans-to-profit-from-coronavirus-pandemic
- Une analyse de Daniel Andler qui va dans le sens du projet de ce site (appel inclus): https://academiesciencesmoralesetpolitiques.fr/2020/05/12/daniel-andler-une-pandemie-a-lere-des-technologies-emergentes
- Trump, capitalisme, monopoles et pandémie (en anglais): https://critinq.wordpress.com/2020/05/05/on-cooperationism-an-end-to-the-economic-plague
- http://tnova.fr/notes/un-balcon-en-foret-2020-essai-comparatif-sur-l-epidemie-de-covid. Analyse approfondie des raisons qui expliquent pourquoi il y a tant ou si peu de morts dans un pays ou un autre, avec mise en doute de l'utilité du confinement (Rosenthal).
- Penser/panser la pandémie, Ehess [vidéo]: https://www.youtube.com/watch?v=FMWXKUQxQcw&feature=emb_logo. Sobre, bien illustré, combinant concepts affutés et culture historique.
- Le confinement contre le contrat social, et possibilités de régénérer ce dernier: https://www.sciencespo.fr/osc/sites/sciencespo.fr.osc/files/masques_et_bergamasques_V6.pdf
- Pandémie, modèles et classes sociales: https://covprehension.org/2020/04/15/q15.html
- État de l'art sur la pandémie, sa durée, les tests, médicaments, vaccins possibles, etc. Séance exceptionnelle de l'Académie des Sciences, le 7 mai [vidéo]: https://www.youtube.com/watch?time_continue=3&v=OCvDDlBD7yk&feature=emb_logo
- Compter les cas de Covid-19: dimensions méthodologique et culturelle de la production des données. La Recherche, https://www.larecherche.fr/covid-19-coronavirus/compter-les-cas-de-covid-19-dimensions-méthodologique-et-culturelle-de-la, Pierre-Olivier Méthot.
- Le choix des Suédois: https://www.contrepoints.org/2020/04/28/370150-coronavirus-letonnante-politique-de-la-suede
- https://reporterre.net/Coronavirus-grace-au-depistage-massif-l-Allemagne-maitrise-l-epidemie
http://www.slate.fr/story/189939/covid-19-france-allemagne-pourquoi-moins-de-morts-qui-raison - Questions essentielles d'économie (planche à billets, dette, etc.): https://www.lemonde.fr/les-decodeurs/article/2020/04/23/coronavirus-d-ou-viennent-tous-ces-milliards-des-plans-de-relance_6037543_4355770.html
- La question de la surmortalité en France (grippes de 1918, 1969, etc.): https://www.revuepolitique.fr/covid-19-et-surmortalite-en-france (D. Andolfatto, 10 avril).
- Incohérence et fragilité des données (D. Boullier, 27 mars): https://shs3g.hypotheses.org/574
- Sicard. Le titre est dans l'url: https://www.franceculture.fr/sciences/didier-sicard-il-est-urgent-denqueter-sur-lorigine-animale-de-lepidemie-de-covid-19
- Un historique de la connaissance scientifique du virus, avec une dimension critique: https://laviedesidees.fr/Savoir-et-prevoir.html
- Confinement à la française et santé publique: https://sfsp.fr/suivre-l-actualite/les-actualites-generales-de-la-sante-publique/le-dossier-du-mois/item/16647-une-pandemie-interroge-les-valeurs-de-la-sante-publique
- Pourquoi pas ce texte, parmi des milliers d'autres du même type? https://reporterre.net/Depister-et-fabriquer-des-masques-sinon-le-confinement-n-aura-servi-a-rien
- Témoignage sur la situation des vieux et du personnel hospitalier (Ardèche): https://www.philomag.com/lactu/temoignages/un-petit-coup-de-gel-42993
- Proximité des éléments de langage de l'OMS et du gouvernement chinois depuis 2017. https://legrandcontinent.eu/fr/2020/04/02/chine-oms-coronavirus.
- https://www.theguardian.com, le célèbre journal britannique dont tous les articles sont accessibles sans abonnement.